Kính gửi: Cục Thuế tỉnh Sơn La

Tổng cục Thuế nhận được công văn số 997/CT-THNVDT ngày 22/11/2013 của Cục Thuế tỉnh Sơn La đề nghị không truy thu đối với thuế GTGT năm 2006, 2007 và tiền phạt chậm nộp của Công ty CP quản lý, sửa chữa và xây dựng công trình giao thông II Sơn La. Về nội dung này, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Về việc xử lý đối với doanh nghiệp theo Quyết định của Kiểm toán Nhà nước, Bộ Tài chính đã có công văn số 13479/BTC-TCT ngày 23/09/2009 về việc kê khai bổ sung và xử lý vi phạm về thuế đối với doanh nghiệp theo kiến nghị của KTNN, tại điểm 4, 5 công văn hướng dẫn như sau:

"4. Trường hợp doanh nghiệp không đồng ý với kiến nghị của KTNN, thì doanh nghiệp phải báo cáo giải trình với KTNN. Sau khi có báo cáo giải trình của doanh nghiệp, KTNN đã có kết luận về giải trình của doanh nghiệp thì doanh nghiệp phải thực hiện theo kiến nghị của KTNN.

5. Đối với doanh nghiệp đã được cơ quan thuế thanh tra, kiểm tra, sau đó KTNN có kiến nghị khác so với kết luận, quyết định xử lý sau thanh tra, kiểm tra của cơ quan thuế, thì xử lý như sau:

- Trường hợp cơ quan thuế trực tiếp trực tiếp quản lý doanh nghiệp nhận thấy kiến nghị của Kiểm toán là đúng và phù hợp với các quy định của pháp luật thì thực hiện theo kiến nghị của KTNN.

- Trường hợp cơ quan thuế trực tiếp quản lý doanh nghiệp nhận thấy kiến nghị của Kiểm toán là chưa phù hợp với các quy định của Pháp luật thì phải có trách nhiệm báo cáo giải trình lại với KTNN. Trường hợp KTNN đồng ý báo cáo giải trình của cơ quan thuế, điều chỉnh lại kết luận tại biên bản KTNN thì thực hiện theo các kết luận của cơ quan KTNN. Trường hợp KTNN không đồng ý với ý kiến giải trình của cơ quan thuế thì cơ quan thuế thực hiện theo kết luận của cơ quan KTNN và cơ quan thuế có trách nhiệm báo cáo Bộ Tài chính về vấn đề này."

Căn cứ hướng dẫn trên, đề nghị Cục Thuế tỉnh Sơn La thực hiện theo điểm 4, 5 công văn số 13479/BTC-TCT ngày 23/09/2009 nêu trên.

Tổng cục Thuế thông báo để Cục Thuế biết./.