Ngày 30/05/2005, Tổng cục Thuế ban hành Công văn số 1624 TCT/ĐTNN trả lời Công ty liên doanh sản xuất bao bì Tong Yuan về miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp theo Thông tư số 88/2004/TT-BTC ngày 01/09/2004, nay Tổng cục Thuế hướng dẫn như sau:

Tại điểm 8 Thông tư số 88/2004/TT-BTC ngày 01/09/2004 của Bộ Tài chính hướng dẫn:

"3. Các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài và bên nước ngoài tham gia hợp đồng hợp tác kinh doanh đã được cấp Giấy phép đầu tư; các cơ sở kinh doanh trong nước đã được cấp Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư tiếp tục được hưởng các ưu đãi về thuế TNDN ghi trong Giấy phép đầu tư, Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư. Trường hợp mức ưu đãi về thuế TNDN ghi trong Giấy phép đầu tư, Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư thấp hơn mức ưu đãi về thuế TNDN hướng dẫn tại Thông tư này thì cơ sở kinh doanh được hưởng các mức ưu đãi về thuế TNDN theo hướng dẫn tại Thông tư này cho khoảng thời gian ưu đãi còn lại (thời gian ưu đãi về thuế theo Giấy phép đầu tư, Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư trừ (-) thời gian ưu đãi về thuế đã được hưởng đến ngày 01/01/2004)."

Bộ Tài chính đã ban hành công văn số 11684/BTC-TCT ngày 16/9/2005 trong đó đã hướng dẫn cụ thể việc xác định thời gian ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN còn lại nêu tại Thông tư số 128/2003/TT-BTC ngày 22/12/2003 và Thông tư số 88/2004/TT-BTC ngày 01/09/2004 của Bộ Tài chính.

Căn cứ quy định của pháp luật về thuế TNDN và hướng dẫn nêu trên thì ưu đãi thuế TNDN đối với Công ty liên doanh sản xuất bao bì Tong Yuan được xác định như sau: Theo Giấy phép đầu tư số 1758/GPĐC4-KCN-BD ngày 09/07/2001 thì Công ty liên doanh sản xuất bao bì Tong Yuan được miễn thuế TNDN 02 năm, kể từ năm kinh doanh có lãi và giảm 50% trong hai năm tiếp theo, trên thực tế năm 1998 Công ty bắt đầu có lãi nên đến hết năm 2001 Công ty đã hết thời gian ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN theo Giấy phép đầu tư. Vì vậy, Công ty không còn thời gian ưu đãi còn lại để được hưởng ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN theo quy định tại Nghị định số 164/2003/NĐ-CP ngày 22/12/2003 của Chính phủ và các văn bản hướng dẫn nêu trên.

Về thuế suất và thời hạn áp dụng thuế suất thuế TNDN ưu đãi: trường hợp thực tế Công ty đáp ứng các điều kiện quy định tại Giấy phép đầu tư đã cấp thì Công ty tiếp tục được áp dụng mức thuế suất thuế TNDN và thời hạn áp dụng theo Giấy phép đầu tư đã cấp.

Cục Thuế tỉnh Bình Dương khi kiểm tra, thanh tra đối với Công ty liên doanh sản xuất bao bì Tong Yuan phải kiểm tra các điều kiện được hưởng ưu đãi thuế TNDN, số thuế Công ty được miễn, giảm được xác định trên cơ sở điều kiện thực tế mà Công ty đáp ứng theo hướng dẫn tại điểm 2.1, Mục IV, Phần E, Thông tư số 128/2003/TT-BTC ngày 22/12/2003 của Bộ Tài chính.

Công văn này thay thế công văn số 1624 TCT/ĐTNN ngày 30/05/2005 của Tổng cục Thuế.

Tổng cục Thuế thông báo để Công ty liên doanh sản xuất bao bì Tong Yuan và Cục Thuế tỉnh Bình Dương xác định nghĩa vụ thuế TNDN của Công ty đúng theo quy định của pháp luật và hướng dẫn tại Công văn này.